MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haemophilus influenzae Rd KW20 chromosome

Total Repeats: 38666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000907	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	16271977
2	NC_000907	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271977
3	NC_000907	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
4	NC_000907	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
5	NC_000907	A	7	7	343	349	100 %	0 %	0 %	0 %	16271977
6	NC_000907	GTTC	2	8	388	395	0 %	50 %	25 %	25 %	16271977
7	NC_000907	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16271977
8	NC_000907	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271977
9	NC_000907	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
10	NC_000907	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	16271977
11	NC_000907	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271977
12	NC_000907	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271977
13	NC_000907	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
14	NC_000907	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271977
15	NC_000907	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
16	NC_000907	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271977
17	NC_000907	CAAA	2	8	972	979	75 %	0 %	0 %	25 %	16271977
18	NC_000907	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271977
19	NC_000907	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16271977
20	NC_000907	A	6	6	1033	1038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000907	T	6	6	1058	1063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000907	AATTT	2	10	1073	1082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000907	AAT	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000907	CAAT	2	8	1126	1133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_000907	TTC	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000907	CAA	3	9	1247	1255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
27	NC_000907	TCAA	2	8	1344	1351	50 %	25 %	0 %	25 %	16271978
28	NC_000907	TTGC	2	8	1364	1371	0 %	50 %	25 %	25 %	16271978
29	NC_000907	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
30	NC_000907	AGCA	2	8	1500	1507	50 %	0 %	25 %	25 %	16271978
31	NC_000907	TCG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
32	NC_000907	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
33	NC_000907	A	6	6	1608	1613	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
34	NC_000907	CCA	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
35	NC_000907	ACA	2	6	1642	1647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
36	NC_000907	TTA	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
37	NC_000907	CAA	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
38	NC_000907	ATTT	2	8	1746	1753	25 %	75 %	0 %	0 %	16271978
39	NC_000907	ATT	2	6	1757	1762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
40	NC_000907	CTTT	2	8	1877	1884	0 %	75 %	0 %	25 %	16271978
41	NC_000907	T	6	6	1882	1887	0 %	100 %	0 %	0 %	16271978
42	NC_000907	TC	3	6	1893	1898	0 %	50 %	0 %	50 %	16271978
43	NC_000907	GGC	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16271978
44	NC_000907	TTC	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271978
45	NC_000907	AGA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
46	NC_000907	A	6	6	2037	2042	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
47	NC_000907	TGC	2	6	2047	2052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16271978
48	NC_000907	GAA	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
49	NC_000907	ATT	2	6	2224	2229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271978
50	NC_000907	G	6	6	2230	2235	0 %	0 %	100 %	0 %	16271978
51	NC_000907	ATG	2	6	2246	2251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
52	NC_000907	GGA	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16271978
53	NC_000907	AAC	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271978
54	NC_000907	AAT	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271978
55	NC_000907	TGA	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271978
56	NC_000907	AAG	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
57	NC_000907	AGA	2	6	2491	2496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
58	NC_000907	ATTT	2	8	2568	2575	25 %	75 %	0 %	0 %	16271978
59	NC_000907	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	16271978
60	NC_000907	CAC	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271978
61	NC_000907	AT	3	6	2635	2640	50 %	50 %	0 %	0 %	16271978
62	NC_000907	ATC	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
63	NC_000907	A	6	6	2699	2704	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
64	NC_000907	GAA	2	6	2744	2749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
65	NC_000907	ACT	2	6	2791	2796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271978
66	NC_000907	A	6	6	2797	2802	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
67	NC_000907	A	7	7	2875	2881	100 %	0 %	0 %	0 %	16271978
68	NC_000907	GCAA	2	8	2973	2980	50 %	0 %	25 %	25 %	16271978
69	NC_000907	AAG	2	6	3003	3008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16271978
70	NC_000907	CTTT	2	8	3037	3044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_000907	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
72	NC_000907	TCT	2	6	3066	3071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
73	NC_000907	ATT	2	6	3095	3100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
74	NC_000907	AAT	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
75	NC_000907	A	6	6	3252	3257	100 %	0 %	0 %	0 %	16271979
76	NC_000907	CGCAC	2	10	3258	3267	20 %	0 %	20 %	60 %	16271979
77	NC_000907	A	6	6	3300	3305	100 %	0 %	0 %	0 %	16271979
78	NC_000907	TCT	2	6	3375	3380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271979
79	NC_000907	AAT	2	6	3389	3394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
80	NC_000907	TCA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
81	NC_000907	ATTT	2	8	3478	3485	25 %	75 %	0 %	0 %	16271979
82	NC_000907	CG	3	6	3493	3498	0 %	0 %	50 %	50 %	16271979
83	NC_000907	ATT	2	6	3509	3514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
84	NC_000907	TAA	2	6	3519	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
85	NC_000907	CAC	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16271979
86	NC_000907	CAA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271979
87	NC_000907	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271979
88	NC_000907	TAA	2	6	3794	3799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16271979
89	NC_000907	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271979
90	NC_000907	ATT	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16271980
91	NC_000907	ATC	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271980
92	NC_000907	TTC	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271980
93	NC_000907	GAC	2	6	4048	4053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271980
94	NC_000907	ATTCT	2	10	4317	4326	20 %	60 %	0 %	20 %	16271980
95	NC_000907	AAT	2	6	4435	4440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000907	TC	3	6	4559	4564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_000907	TTTCCT	2	12	4613	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271981
98	NC_000907	T	6	6	4731	4736	0 %	100 %	0 %	0 %	16271981
99	NC_000907	CTCG	2	8	4751	4758	0 %	25 %	25 %	50 %	16271981
100	NC_000907	TAAAA	2	10	4768	4777	80 %	20 %	0 %	0 %	16271981
101	NC_000907	CCAA	2	8	4804	4811	50 %	0 %	0 %	50 %	16271981
102	NC_000907	T	7	7	4928	4934	0 %	100 %	0 %	0 %	16271981
103	NC_000907	TA	3	6	5007	5012	50 %	50 %	0 %	0 %	16271981
104	NC_000907	ACG	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16271981
105	NC_000907	ACA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16271981
106	NC_000907	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271981
107	NC_000907	CAT	2	6	5239	5244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271981
108	NC_000907	TA	3	6	5265	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	16271981
109	NC_000907	TTG	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16271981
110	NC_000907	T	6	6	5342	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	16271981
111	NC_000907	A	6	6	5356	5361	100 %	0 %	0 %	0 %	16271981
112	NC_000907	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000907	ATT	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000907	TTG	2	6	5466	5471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000907	A	6	6	5505	5510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000907	GAT	2	6	5548	5553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000907	TA	3	6	5555	5560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000907	AG	3	6	5563	5568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000907	TAT	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000907	CTA	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_000907	CTAT	2	8	5619	5626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_000907	CAA	2	6	5634	5639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_000907	TTG	3	9	5641	5649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000907	AAG	2	6	5673	5678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000907	TTC	2	6	5683	5688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_000907	AGG	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000907	ATT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000907	CG	3	6	5785	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000907	TGT	2	6	5837	5842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000907	TA	3	6	5843	5848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000907	AGC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_000907	ATC	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_000907	CAGT	2	8	5939	5946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_000907	GTG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000907	TTG	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000907	TTA	2	6	6208	6213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000907	CAT	2	6	6302	6307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_000907	ATC	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_000907	GAA	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000907	ATC	2	6	6445	6450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_000907	GTTCTG	2	12	6509	6520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_000907	AAAC	2	8	6560	6567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_000907	CAT	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_000907	TGA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000907	GAA	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000907	TGA	2	6	6708	6713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000907	ACA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_000907	CTT	2	6	6840	6845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_000907	GAA	2	6	6856	6861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000907	TAT	2	6	7171	7176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000907	ATG	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000907	TGA	2	6	7310	7315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000907	AAATAA	2	12	7374	7385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_000907	CACAAC	2	12	8423	8434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_000907	TCG	2	6	8508	8513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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274	NC_000907	T	7	7	13593	13599	0 %	100 %	0 %	0 %	16271988
275	NC_000907	ATTT	2	8	13630	13637	25 %	75 %	0 %	0 %	16271988
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278	NC_000907	TCT	2	6	13778	13783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16271988
279	NC_000907	ATG	2	6	13789	13794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16271988
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413	NC_000907	CAT	2	6	20289	20294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16271994
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